Descripción de tipos de carbapenemasas expresadas en Klebsiella sp. Y Pseudomonas aeruginosa en hospitales de tercer nivel de la ciudad de Bogotá, estudio descriptivo. Parte 1

Abstract

Introducción: La resistencia a carbapenémicos es un problema de salud pública, con un impacto negativo en la morbimortalidad de los pacientes afectados. Actualmente se cuenta con múltiples registros de diversos mecanismos de resistencia, así como identificación molecular de diversos tipos de carbapenemasas; sin embargo la frecuencia y distribución de estas últimas es desconocida en la ciudad de Bogotá. D.C. (Colombia). Objetivo: Caracterizar y describir la frecuencia de los diferentes tipos de carbapenemasas en Pseudomona aeruginosa y Klebsiella sp., en distintas instituciones hospitalarias de la ciudad de Bogotá. A partir de los datos recolectados se planea obtener los tipos y las frecuencias de las mismas. Metodología: Teniendo en cuenta los porcentajes de resistencia a carbapenémicos en Bogotá, se calculó un tamaño de la muestra a recolectar. En 6 instituciones de tercer nivel de complejidad se realizó la recolección de estos microorganismos a los cuales se les realizó múltiples pruebas fenotipicas (Test de Hodge, EDTA, Acido borónico, carbaNP, mCIM) con el fin de documentar la producción de carbapenemasa y posteriormente se hicieron pruebas de reacción en cadena de polimerasa para la deteccion de diferentes genes de carbapenemasas (KPC, GES, IMP, VIM, NDM, OXA-48) cuyos resultados se describirán. Resultados: La probabilidad de producción de carbapenemasas en Pseudomonas aeruginosa fue entre 64 – 80%, con alta producción de KPC (55%) en comparación con la de metalobetalactamasas (15%), situación contraria a la documentada en la literatura mundial. En Klebsiella sp., se documentó una probabilidad de producción de carbapenemasas de 98%, predominantemente del tipo KPC en el 96.8%, con cepas aisladas que tuvieron co-producción KPC-Metalobetalactamasa (VIM/NMD). La prueba de detección fenotipica CarbaNP tuvo una concordancia muy alta en detección de carbapenemasas de cualquier tipo.

Abstract: Introduction: The resistance trends to carbapenems is a public health problem, with an important impact in terms of mortality and morbidity outcomes of affected patients. Currently there are multiple registers available of different resistance mechanisms, as well as the molecular identification of various types of carbapenemases; however the frequency and distribution of this type of carbapenemases is unknown in the city of Bogotá. D.C. (Colombia). Objective: To characterize and describe the frequency from the different types of carbapenemases in Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella sp., in various hospitals in Bogotá D.C. With the data collected we have the purpose to obtain the molecular types and frecuency of them. Methodology: Based on the previous reported percentages of carbapenemic resistance in Bogotá D.C, a sample size was calculated. We carried out the collection of this microorganisms in 6 tertiary level hospitals, subsequently, we performed multiple phenotypic tests among the collected strains (modified Hodge test, EDTA, boronic ácid, carbaNP and mCIM) in order to document the production of carbapenemase and subsequently we carried out polymerase chain reaction for the specific detection of different carbapenemase genes (KPC, GES, IMP, VIM, NDM, OXA-48) whose results will be described. Results: The probability of carbapenemase production in Pseudomonas aeruginosa was settled between 64 - 80%, with high production of KPC (55%) compared to that of metallobetalactamases (15%), contrary to the situation documented in the literature. In Klebsiella sp., we found a probability of carbapenemase production of 98%, predominatly by carbapenemase type KCP in 96.8%, with isolated cases of co-production of KPCMetallobetalactamase (VIM, NDM) The CarbaNP phenotypic detection test had a very high concordance in the detection of carbapenemases independently of their molecular type.