Implementación de una metodología in silico usando el modelo oculto de Markov para la identificación de proteínas involucradas en el mecanismo de señalización con Ubiquitina en el sistema Uubiquitina-Proteosoma en el parásito Giardia intestinalis
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Autores
Castellanos, Isabel Cristina
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Español
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Resumen
Nosotros desarrollamos un LINUX Bash Script para la identificación del sistema de Ubiquitinación usando el HMM. Identificamos 256 secuencias del sistema de Ubiquitinación en Giardia y seleccionamos una de estas secuencias para su estudio experimental; el ortólogo OTU. La actividad OTU de esta secuencia fue confirmada por primera vez en Giardia y en un organismo protozoario, siendo este el soporte de la pertinencia de nuestra aproximación bioinformática. / Abstract. We developed a LINUX Bash Scrip for the identification the Ubiquitin system using HMM. We identified 256 sequences of the Ubiquitin System in Giardia and one sequence was studied experimentally; it is a OUT ortolog. The OUT activity was confirmed for first time in Giardia and in a one Protozoan organism. This evidence is a supporting the usefulness of this bioinformatics.