Maestría en Bioinformática
Recent Submissions
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Modelo de epistasis basado en aprendizaje automático para pacientes con discapacidad intelectual y retraso del neurodesarrollo
Los estudios de asociación como epistasis representan un factor importante en la comprensión de la expresión de enfermedades complejas, como lo son los trastornos del neurodesarrollo (TND), que presentan un desafío en el ... -
Modelo de aprendizaje automático de integración de datos genómicos, epigenómicos, transcriptómicos y clínicos provenientes de estudios de cáncer de endometrio y de cáncer de mama
El cáncer de mama y el cáncer de endometrio son enfermedades complejas que presentan mucha heterogeneidad a nivel molecular e histológico. Ciertos pacientes de estos dos tipos de cáncer comparten tanto mecanismos moleculares ... -
Modelo in-silico para la predicción de péptidos con restricción HLA-l candidatos a vacuna en SARS-CoV-2
En este trabajo se resalta la importancia de las herramientas computacionales en el diseño de vacunas contra el SARS-CoV-2, virus que desde su descubrimiento en Wuhan China en diciembre de 2019, entre los años 2020 y 2022, ... -
Pipeline bioinformático para el seguimiento epidemiológico de bacterias multirresistentes dentro de un hospital a partir de genoma completo y datos clínicos
La resistencia a los antimicrobianos es una amenaza de salud pública reconocida a nivel mundial y cobra especial atención en entidades hospitalarias, donde se presentas brotes infecciosos problemáticos por la resistencia ... -
Modelo basado en técnicas de machine learning para la clasificación de virus de ARN
Los virus son las entidades biológicas más abundantes de la Tierra, pero detectarlos, aislarlos y clasificarlos ha sido todo un reto para la ciencia. Los virus de ARN patógenos causan numerosas muertes humanas, especialmente ... -
Evaluación de herramientas bioinformáticas útiles en la tipificación de Klebsiella pneumoniae y Pseudomonas aeruginosa a partir de datos de secuenciación de genomas completos
La Secuencia del Genoma Completo se obtiene mediante las tecnologías de secuenciación, especialmente las de próxima generación (NGS). Gracias a su alto poder discriminatorio, simplicidad, precisión, velocidad y flexibilidad, ... -
Modelo de aprendizaje automático para predecir el riesgo de evento adverso en analgésicos opioides aplicando datos de secuenciación de última generación (NGS) en una población de pacientes colombianos
OBJETIVO: Desarrollar un modelo basado en aprendizaje automático para la predicción del riesgo de evento adverso, a partir del genotipo en farmacogenes asociados con la farmacocinética y farmacodinámica de analgésicos ... -
Identificación de reacciones controladoras en un modelo computacional multi-ómico astrocitario de lipotoxicidad inducida por ácido palmítico
Los astrocitos juegan un papel importante en varios procesos en el cerebro, incluidas condiciones patológicas como las enfermedades neurodegenerativas. Estudios recientes han demostrado que el aumento de ácidos grasos ... -
Modelado computacional de astrocito humano usando datos de transcriptómica y proteómica
Aunque la astrogliosis está relacionada con eventos neuroprotectores; su neurotoxicidad se ha correlacionado con enfermedades neurodegenerativas y otros desórdenes (Sofroniew & Vinters, 2010). Lo que ha aumentado la ... -
Análisis de metodologías estadísticas en RNA-seq, con aplicación a cáncer de pulmón
La identificación de genes expresados diferencialmente en un grupo de pacientes que padezcan una enfermedad, es un primer paso en el desarrollo de procedimientos para la detección temprana de dicha enfermedad en los pacientes ... -
Protocolo computacional para la asignación taxonómica de virus en metadatos genómicos
Los virus están ampliamente distribuidos en todos los ecosistemas naturales y son el grupo de entidades biológicas más diverso conocido. Aunque su biodiversidad biológica estimada es de 31 ordenes de magnitud, nuestro ... -
Modelo Computacional para el análisis de historias clínicas de pacientes con Artritis Reumatoide aplicando bioinformática traslacional y minería de textos
Este trabajo tiene como finalidad crear un modelo computacional que permita identificar el avance de la enfermedad de artritis reumatoide (AR) con base en el análisis de historias clínicas de pacientes diagnosticados con ... -
Identificación y clasificación de las rutas metabólicas de las especies de Leptospira spp
El aislamiento de Leptospira spp. es considerado como la prueba de laboratorio de mayor fiabilidad para el diagnostico de leptospirosis. Sin embargo, las limitaciones del cultivo impiden su implementación para el diagnostico ... -
Modelo farmacogenético y clínico para la predicción de desenlaces en pacientes con artritis reumatoide tratados con metotrexato y adalimumab
GOAL: To develop a pharmacogenetic and clinical model to predict effectiveness outcomes in a cohort of patients diagnosed with rheumatoid arthritis (RA) treated with methotrexate or adalimumab at the Central Military ... -
Modelo integrado para la caracterización in silico del efecto de la diversidad genética sobre regiones estructuradas codificantes y no codificantes del virus del Dengue
La diversidad y evolución genética del virus Dengue (DENV) ha sido un tema de atención en virología abordado para comprender las interacciones que surgen entre él y sus hospederos lo cual involucra descifrar el desarrollo ... -
Construcción de una plataforma computacional para la identificación de relaciones sinténicas entre subregiones genómicas asociadas al sistema inmune innato del organismo D. vexillum y otros tunicados
This works presents protocols and results associated to identify sintenic relationships between subgenomics regions associated with the innate immune system of the organism Didemnum vexillum and other Tunicates. In order ... -
Diseño, modelamiento y evaluación in silico de péptidos que reconocen antígeno Tn
El antígeno Tn (GalNac α-Ser / Thr) fue descrito por primera vez en pacientes con una rara enfermedad hemolítica (síndrome Tn), y desde que se descubrió su presencia en el 90 % de los carcinomas a mediados de la década de ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Standardization of a methodology for identification and annotation of associations between single nucleotide polymorphisms and highly polygenic traits in ruminants
Given the importance of the production of ruminants, it is necessary to investigate the genetic variants associated with the traits of economic interest in these animals, as well as the biology underlying the genotype-phenotype ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Asociación de variantes en regiones codificantes de genes con datos clı́nicos en pacientes colombianos usando minerı́a de datos
En esta tesis de maestrı́a se propone un modelo para el análisis de variantes en regiones codificantes de genes en pacientes colombianos. Los datos corresponden a 227 pacientes a los cuales se les secuenciaron 4813 genes ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial Ingeniería de Sistemas. -
Método computacional para establecer un esquema de identificación de Mycobacterium tuberculosis a partir de secuencias genómicas
El complejo Mycobacterium tuberculosis es un grupo de agentes patógenicos caracterizados principalmente por causar tuberculosis en distintos animales. En la actualidad métodos más eficientes y efectivos para identificar ...