Caracterización del microbioma bacteriano intestinal del críticamente amenazado Cocodrilo del Orinoco (Crocodylus intermedius) presente en la mayor población ex situ en la Estación de Biología Tropical Roberto Franco (EBTRF) en Villavicencio, Colombia
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Autores
Polanco Rodríguez, María Camila
Director
Vargas Ramírez, Mario
Tipo de contenido
Trabajo de grado - Maestría
Idioma del documento
EspañolFecha de publicación
2023
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Resumen
El Cocodrilo del Orinoco (Crocodylus intermedius) es un reptil endémico de zonas bajas de la cuenca del río Orinoco. Actualmente la especie enfrenta serias amenazas para su supervivencia, por lo cual es necesario un plan de conservación integral que incluya programas modernos como el mantenimiento de un microbioma saludable, lo cual puede mejorar su mantenimiento, reproducción y liberación. Este estudio tuvo como objetivo caracterizar la microbiota bacteriana de las heces de C. intermedius, mantenidos en la mayor población ex-situ colombiana (EBTRF, Villavicencio, Meta) y comparar las poblaciones bacterianas entre cocodrilos juveniles y adultos. Se realizó la secuenciación del gen rRNA 16S de 24 muestras de materia fecal (Juveniles n=15; Adultos n=9), utilizando el equipo Illumina MiSeq (2×250 bp). Los resultados indican que la microbiota fecal de está predominada por Firmicutes, seguido por Bacteroidetes y Proteobacterias. Los índices de medición de Alfa diversidad y la estructura bacteriana no tuvieron una diferencia significativa entre los Juveniles y Adultos, sin embargo, el membership de las poblaciones bacterianas difirió significativamente entre los grupos. La composición de la microbiota fecal de ambos estuvo fuertemente predominada por Firmicutes y Bacteroidetes, distribución que se ha relacionado con enfermedades como la obesidad y desórdenes endocrinos. A pesar de que investigaciones previas han reportado bacterias patógenas en la microbiota fecal, los reptiles poseen un fuerte sistema inmunológico que podría conferir una mayor resistencia a infecciones, cáncer y senescencia. Esta investigación presenta una herramienta para la conservación del Cocodrilo del Orinoco y amplía el conocimiento de la microbiota en reptiles. (Texto tomado de la fuente)
Abstract
The Orinoco Crocodile (Crocodylus intermedius) is an endemic reptile found in lowland areas of the Orinoco River basin. Currently, the species faces serious threats to its survival, demanding an all-encompassing conservation program that includes modern programs such as maintaining a healthy microbiome, which can improve its maintenance, reproduction, and release. This study aimed to characterize the bacterial microbiota of feces from C. intermedius kept in the largest ex-situ Colombian population (EBTRF, Villavicencio, Meta) and compare the bacterial populations between juvenile and adult crocodiles. The 16S rRNA gene sequencing was performed on 24 fecal samples (Juveniles n=15; Adults n=9), using the Illumina MiSeq platform (2×250 bp). The results indicate that the fecal microbiota is predominantly composed of Firmicutes, followed by Bacteroidetes and Proteobacteria in both groups. Alpha diversity and bacterial structure measurements did not show significant differences between juveniles and adults; however, the membership of bacterial populations differed significantly between the groups. The majority presence of Firmicutes and Bacteroidetes have been associated with diseases such as obesity and endocrine disorders in reptiles. Despite previous reports of pathogenic bacteria in the fecal microbiota, reptiles possess a robust immune system that may confer greater resistance to infections, cancer, and senescence. This research provides a tool for the conservation of the Orinoco Crocodile and expands our understanding of reptilian fecal microbiota.
Palabras clave
Descripción Física/Lógica/Digital
ilustraciones, diagramas, mapa