Evaluación de un marcador molecular asociado al lento oscurecimiento de la testa de la semilla de frijol (Phaseolus vulgaris).
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Autores
Cantor Saavedra, Juan Pablo
Tipo de contenido
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Español
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Resumen
La selección asistida por marcadores (MAS) ha sido efectiva para identificar distintos rasgos como
la resistencia a enfermedades. En el caso del frijol común, se ha tenido éxito en la resistencia a
enfermedades y algunos insectos, aunque hay avances incipientes en el estudio de rasgos
cuantitativos como rendimiento y tolerancia a sequía. En el presente estudio, se identificó y se diseñó
un marcador molecular tipo SNP en el gen bHLH que interviene en rutas metabólicas de algunos
flavonoides asociados al oscurecimiento de la testa del frijol al interactuar con el gen Pigment,
responsable del color de semilla y comúnmente asociado al tamaño de semilla. Las poblaciones de
estudio se obtuvieron mediante el cruzamiento simple de una línea desarrollada para el rasgo de
lento oscurecimiento (ND-Palomino) como fuente del marcador, con dos líneas locales de los
acervos Andino y Mesoamericano. Se hizo una extracción fenólica en la fase de diseño de los
cebadores y la validación en las generaciones F1 y F2 con la extracción alcalina de ADN. Se aceleró
el oscurecimiento de las semillas mediante exposición a luz ultravioleta durante diferentes periodos
de tiempo (0, 24, 48 y 72 horas) en genotipos seleccionados con datos de genotipado en poblaciones
F3 de fríjol. Se tomaron fotografías en formato RGB dentro de una plataforma de fenotipado
denominada ImagingCrop, que luego se ajustaron para el análisis y se transformaron al espectro
L*a*b. Se encontraron diferencias significativas entre los genotipos basados en el marcador
snpPv00135, con el valor medio de L, espacio que explica el 0.4414 de la variación asociada a este
rasgo, con valores de 64.12 para el alelo positivo y 58.73 para el alelo negativo, con un valor de p
inferior a 0.001. (Texto tomado de la fuente)
Abstract
Marker-assisted selection (MAS) has been effective in identifying various traits, such as disease
resistance. In the case of common beans, success has been achieved in resistance to diseases and
some insects, although there have been only initial advances in the study of quantitative traits such
as yield and drought tolerance. In this study, a molecular SNP marker was identified and designed
within the bHLH gene, which is involved in metabolic pathways of certain flavonoids associated
with seed coat darkening by interacting with the Pigment gene, responsible for seed color and
commonly linked to seed size. The study populations were obtained through a simple cross between
a line developed for the slow darkening trait (ND-Palomino) as a source of the marker and two local
lines from the Andean and Mesoamerican gene pools. Phenolic extraction was performed during the
primer design phase, and validation was carried out in F1 and F2 generations using alkaline DNA
extraction. Seed darkening was accelerated by exposure to ultraviolet light for different periods (0,
24, 48, and 72 hours) in genotypes selected with genotyping data in F3 bean populations. RGBformat photographs were taken within a phenotyping platform called ImagingCrop, which were then
adjusted for analysis and transformed into the L*a*b spectrum. Significant differences were found
between genotypes based on the snpPv00135 marker, with the mean value of L, explaining 0.4414
of the variation associated to this trait, with values of 64.12 for the positive genotypes and 58.73 for
the negatives, with a p-value less than 0.001.
Palabras clave propuestas
Descripción
Ilustraciones, tablas